顺治三年，正月二十六日。商毅收到了杭州发来的消息，明朝已经又有人被推立为监国，而且这回居然一下子推出了两位监国，一是潞王朱常芳，在徽州被推立为监国，另一位是鲁王朱以海，是在处州出任监国。
其实不仅仅是史可法和吴甡想到要推立新君，以号令南方抗击清军，有不少眀朝的官员为想到了这一点，在南京城破之后，还有一批官员既没有投降清军，也没有依附商家军，但依然趁着当天的混乱逃出南京，聚集到徽州，因为许多官员都知道，潞王朱常淓就被安置在徽州。
而在十多天之后，南京城破，朱由崧身亡的消息也得到了确认，并且传遍了整个南方。而且又有许多的官员也都陆续聚集到了徽州，其中大部份都是东林一系的官员，包括黄宗羲、黄震周等一些比较知名的人士,还有朱大典、袁宏勋、张秉贞、何纶等地方派势人。因为朱常淓本来就是东林党推崇的皇帝人选，现在朱甴崧己死，那么再拥立朱常淓，也就是顺理成章的事情了。
于是众人商议决定，拥立朱常淓为监囯，号令南方，另外还有原明总兵方国安和侄儿方元科，手下约有一万多兵马,也来到徽州,拥立朱常淓。
结果等史可法一行到达徽州的时侯，己经晚了一步，就在前一天，朱常淓己经正式出任了监国，并任命张秉贞为兵部尚、朱大典为吏部尚、黄宗羲为礼部尚、袁宏勋为户部尚，方国安为左督都，总理军务。
不过史可法等人到来，还是受到朱常淓的欢迎，因为现在史可法的名望不小，而且朱常淓也知道，在史可法的背后，还有商毅的支持，现在谁都知道，整个南方，只有商毅的商家军，才能够抵抗清军。由其是史可法还带来了一个令他们震惊的消息，原来南京竟然还没有完全失守，商毅依然还在南京城里与清军对持，坚守着南京，而且还在南京周边地区多次打败清军。
这个消息确实让徽州的众官员都振奋不己，也包括朱常淓在内。因为朱常淓出任监国本来就十分免强，他当然知道在这个时侯出任监国，甚致是称帝，可不是天下掉下的馅饼，而是被架到火烤，一但清军杀到，恐怕就会首先拿自己开刀。而现在看来，南京居然还守得住，只要南京不失，清军就无瑕南下，而自已也就能够保住现在的位置，另外商毅也明确表示，支持自已监国，当然也舒心了不少。
而其他官员也都有差不多的想法，因此尽管黄宗羲、黄镇周等人曾在南京和史可法斗得不亦乐乎，但在这个时候，也都对史可法等人表示了欢迎的态度，众人相见之后，先是互相大哭一场，悲痛朱由崧架崩，史可法也知道，现在不是翻旧怅的时侯，众人团结一致，抵抗淸军比什么都重要，因此双方都非常有默契的没有提在南京顺逆之争的那些事情。并且都表示一定会齐心协力，共同抵抗清军。
但表面文章虽然是做得十足，一涉及到实际问题的时候，这些官员们就立刻旧病复发，当史可法向众人提议，请朱常淓立刻到杭州去坐镇，朱大典、袁宏勋、张秉贞、黄宗羲、黄镇周等人马都顾左右而谈他，并不做正面的答复。
因为生存的危机得到了缓解之后，各人立刻都开始打各人的小算盘，杭州可是商毅的地盘，而且史可法这一行人显然都己经和商毅结成一伙，一但朱常淓到了杭州，肯定成为商毅的傀儡，而史可法、吴甡等人，也一定会成为新朝廷的内阁重臣，那么那里还有自己的位置呢，但这个理由是没法说出口的，因此也都纷纷找借口推辞，只说事关重大，应当从长计议。史可法也就不好再说什么了。
而在私下里，有不少官员都向朱常淓进言，千万不要去杭州，因为商毅为人飞扬跋扈，桀骜不驯，而且又手握重兵，素有野心，决不可信任，一但去了杭州，就会被商毅架空成傀儡。
朱常淓其实到是很想去杭州，一来杭州是个大地方，肯定出徵州要舒服，二来直接在商家军的保护之下，也更安全一些，致于成为商毅的傀儡，朱常淓到并不太在意，因为现在朱常淓手里也没有什么实权，都是由张秉贞、黄宗羲、朱大典等人说了算。而且朱常淓也没有多少政治野心，如果一定是要当傀儡的话，那么宁可给一个实力强的地方势力当傀儡，起码也能过得舒心一些。但去不去杭州，并不是由朱常淓说了算，因此他也无可奈何。
就在第二天，黄镇周奏，称弘光架崩之后，国不可一日无君，因此建议朱常淓立刻在徽州称帝，也好名正言顺，使群臣百官有所瞻依。
这个建议也得到众官员的一致赞同，当然大家彼此都是心照不宣，一但朱常淓在徽州称帝，正好可以借此为由，暂时不去杭州，而称帝的仪式虽然单简，但前前后后至少也要一个月的时间，也可以拖一个月，至于一个月以后怎么办，到时候再想办法。
史可法多少也了解一些众人的想法，心里当然也非常不痛快，这都是什么时候了，居然还有心争权夺利。但这话也不好直说，而且他到也不反对朱常淓称帝，因此也借机建议，请朱常淓到杭州称帝。
就在这时，史可法收到从杭州发来的消息，鲁王朱以海，在张国维、方逢年、钱肃乐、张名振、张煌言等人的拥立下，在处州出任监国。
原来南京被攻破的消息传开之后，在浙江处州府定居的明朝原兵部尚张国维汇同一批聚集在浙江的官员们商议，认为急需迎立一位明朝宗室出任监国，然后号招南方抗击清军。而因为当时消息不通，朱常淓刚刚出任监国还没几天，內部的事情都还没有理顺，也没有来得通告各地，因此只能在浙江一带选择，被安置在温州平阳的鲁王朱以海，也就成为他们拥立的惟一人选,被接到了处州龙泉县。
虽然朱以海被拥立为监国，但实际现在他手下只有十几名大臣，数百士兵，完全是一个地道的草台班子。而拥有的地方也就是一个县城，处州本来是商家军的管辖地区，官员和百姓对鲁监国并不感冒，没有商毅的命令，谁鄀不敢去搭理他们，处州知府虽然接到了发来的公文，但也装不知道。
因此在朱以海被拥立为监国之后，立刻派张煌言为使，赶到杭州，来见商毅，通告此事，当然是希望得到商毅的支持。毕竟他们也知道，现在整个南方，只有商家军靠得住。
不过等张煌言赶到了杭州之后才知道，现在商毅并不在杭州，而是在南京坚守，继续和淸军作战，接待他的是王夫之。而留守杭州的叶瑶瑱也以此为借口，对是否支持鲁王监国也不置可否，推说要请示商毅，才能做决定。张煌言也没有别的办法，只好先留在杭州等着。
而留在杭州的吴甡也吓了一大跳，如果让朱以海抢了先，那可就麻烦了，这不是又弄出来一个马士英第二吗因此也赶快派人给史可法送信，让他快把朱常淓接到杭州来，免得夜长梦多。
这个消息立刻在徽州引起了一阵喧哗，因为在徽州的这些官员看来，自己拥立的朱常淓当然是代表着正统，而朱以海算什么，凭什么也能被立为监国，从血缘来说，朱常淓也比朱以海占优。因此有不少人都言，应该派人立刻去温州，要求朱以海取消监国的称号，还有人主张发兵去打朱以海。
这时史可法又再次建议，朱常淓应该立刻赶去杭州继位，因为只要朱常淓到了杭州，商毅也就可以名正言顺的拒绝朱以海的要求，同时朱常淓还可以借助商毅的兵势，迫使朱以海取消监国。
在这个时候，这当然是最好的选择，毕竟在这个时侯，血缘优势，己经起不了多大作用了，实力才能决定一切，谁能够得到商毅的全力支持，谁就能在这场争夺中占优，但这个正确的建议显然是不能被徽州的官员所接受，相反到成为阻止朱常淓去杭州的最好借口。
张秉贞首先奏，建议朱常淓就在徽州立刻称帝，这样一来，就可以抢在朱以海前面称帝，在大名份可以压倒朱以海一头，并且请史可法为代表，去温州责问朱以海。目地是像朱以海表明，商毅是支持朱常淓的。这个建议当然也得到了其他官员们的一致同意。
可惜他们的如意算盘打得虽好，但却引起了史可法的极大不满，当场就拒绝了代表朱常淓去责问朱以海的要求，同时也表示，自己第二天就返回杭州。
徽州的官员对此也不敢强求，史可法走了也好，免得老是劝朱常淓去杭州。不过他们也担心商毅真的倒向朱以海一方，因此最后还是商议决定，派黄宗羲为代表，跟史可法去杭州，策封商毅也越国公，以此笼络商毅，同时又以黄道周为使，去温州责问朱以海。